Le Maître (Souverain Maître ou Grand Maître) :

Chef suprême de l'Ordre. Il a sous sa coupe, toutes les commanderies d’Orient et d'Occident.
Il est assisté de grands officiers et du couvent. Ses représentants sont les Visiteurs. Voir la liste des Grands Maîtres.

- le sénéchal : lieutenant du Maître
- le maréchal : chef militaire. Il est assisté de :
- turcoplier : commandant des troupes auxiliaires
- gonfanonier : commandant des écuyers
- sous-maréchal : responsable des frères de métier
- le commandeur du royaume de Jérusalem: Trésorier de l’Ordre
- le commandeur de la cité de Jérusalem
- les commandeurs d'Acre, d'Antioche, de Tripoli, etc.
- les commandeurs des forteresses templières et des autres commanderies de plus petite importance
- les chevaliers du Temple
- les sergents
- les frères de métier
- les troupes auxiliaires (turcoples ou turcopoles)
 

L'état-major se transporta à Chypre et resta à peu près le même, avec un nombre très réduit de commanderies.

Les possessions templières augmentant au fil du temps, l'Ordre a institué des circonscriptions administratives en France, en Allemagne, en Angleterre, en Espagne, en Italie, en Hongrie, etc.
Ces circonscriptions se divisaient en provinces, qui se subdivisaient en baylies (ou baillies) regroupant plusieurs commanderies.

Dans chaque circonsription, l'organisation différait légérement, mais on peut la calquer sur celle de la France:

- Maître en France : le dernier fût Gérard de Villers, en 1307. Il est subordonné directement au Grand Maître et à son Visiteur pour la France
- Maîtres (ou précepteurs) des provinces : par exemple, Geoffroy de Gonneville, Maître en Aquitaine et Poitou
- Maîtres (ou précepteurs) des baylies
- Commandeurs (ou précepteurs) des commanderies : il s'agissait parfois de frères-sergents si la taille s'y prêtait
- Chevaliers
- Sergents
- Freres de métier
- Serviteurs